MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-USMARC-183

Total Repeats: 44995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020833	GCA	2	6	275299	275304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332773
4502	NC_020833	AAT	2	6	275316	275321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332773
4503	NC_020833	A	6	6	275349	275354	100 %	0 %	0 %	0 %	472332773
4504	NC_020833	A	6	6	275385	275390	100 %	0 %	0 %	0 %	472332773
4505	NC_020833	GTT	2	6	275409	275414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332773
4506	NC_020833	CGGT	2	8	275481	275488	0 %	25 %	50 %	25 %	472332773
4507	NC_020833	GTT	2	6	275498	275503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332773
4508	NC_020833	CAT	2	6	275505	275510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332773
4509	NC_020833	TTG	2	6	275511	275516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332773
4510	NC_020833	AAAT	2	8	275648	275655	75 %	25 %	0 %	0 %	472332773
4511	NC_020833	ATT	2	6	275934	275939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332774
4512	NC_020833	TCA	2	6	275985	275990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332774
4513	NC_020833	CTT	2	6	276003	276008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332774
4514	NC_020833	GCA	2	6	276125	276130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332774
4515	NC_020833	CTT	2	6	276141	276146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332774
4516	NC_020833	AGC	2	6	276198	276203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332774
4517	NC_020833	TAA	2	6	276205	276210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332774
4518	NC_020833	T	6	6	276343	276348	0 %	100 %	0 %	0 %	472332774
4519	NC_020833	TCT	2	6	276353	276358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332774
4520	NC_020833	CTT	2	6	276453	276458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	472332774
4521	NC_020833	TTG	2	6	276525	276530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332774
4522	NC_020833	TTGT	2	8	276589	276596	0 %	75 %	25 %	0 %	472332774
4523	NC_020833	ATTC	2	8	276676	276683	25 %	50 %	0 %	25 %	472332774
4524	NC_020833	T	6	6	276715	276720	0 %	100 %	0 %	0 %	472332774
4525	NC_020833	AGT	2	6	276852	276857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332774
4526	NC_020833	AACG	2	8	276873	276880	50 %	0 %	25 %	25 %	472332774
4527	NC_020833	ATA	2	6	277094	277099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332774
4528	NC_020833	CCG	2	6	277136	277141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	472332774
4529	NC_020833	ATGG	2	8	277155	277162	25 %	25 %	50 %	0 %	472332774
4530	NC_020833	AG	3	6	277316	277321	50 %	0 %	50 %	0 %	472332774
4531	NC_020833	GCA	2	6	277469	277474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	472332774
4532	NC_020833	TTA	2	6	277506	277511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332774
4533	NC_020833	TCA	2	6	277826	277831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	472332775
4534	NC_020833	TGA	2	6	277835	277840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332775
4535	NC_020833	T	7	7	277926	277932	0 %	100 %	0 %	0 %	472332775
4536	NC_020833	TTG	2	6	277968	277973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332775
4537	NC_020833	AGTA	2	8	277979	277986	50 %	25 %	25 %	0 %	472332775
4538	NC_020833	CTTT	2	8	277991	277998	0 %	75 %	0 %	25 %	472332775
4539	NC_020833	ATT	2	6	278041	278046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332775
4540	NC_020833	CTG	2	6	278076	278081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332775
4541	NC_020833	GAT	2	6	278097	278102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332775
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4543	NC_020833	A	6	6	278197	278202	100 %	0 %	0 %	0 %	472332775
4544	NC_020833	CAC	2	6	278230	278235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332775
4545	NC_020833	A	7	7	278396	278402	100 %	0 %	0 %	0 %	472332775
4546	NC_020833	CT	3	6	278424	278429	0 %	50 %	0 %	50 %	472332775
4547	NC_020833	TC	3	6	278457	278462	0 %	50 %	0 %	50 %	472332775
4548	NC_020833	CT	4	8	278505	278512	0 %	50 %	0 %	50 %	472332775
4549	NC_020833	AAT	2	6	278656	278661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332776
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4551	NC_020833	GTG	2	6	278757	278762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332776
4552	NC_020833	T	7	7	278829	278835	0 %	100 %	0 %	0 %	472332776
4553	NC_020833	AGGTG	2	10	278845	278854	20 %	20 %	60 %	0 %	472332776
4554	NC_020833	TAT	2	6	278894	278899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332776
4555	NC_020833	TATTT	2	10	278907	278916	20 %	80 %	0 %	0 %	472332776
4556	NC_020833	ATT	2	6	278922	278927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332776
4557	NC_020833	GAT	3	9	278999	279007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332776
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4559	NC_020833	GCT	2	6	279248	279253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332776
4560	NC_020833	TAT	2	6	279271	279276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332776
4561	NC_020833	TAT	2	6	279312	279317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332777
4562	NC_020833	T	8	8	279376	279383	0 %	100 %	0 %	0 %	472332777
4563	NC_020833	ATT	2	6	279429	279434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332777
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4566	NC_020833	TGA	2	6	279510	279515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332777
4567	NC_020833	CTTGC	2	10	279556	279565	0 %	40 %	20 %	40 %	472332777
4568	NC_020833	GCT	2	6	279600	279605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332777
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4571	NC_020833	ATT	2	6	279693	279698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332777
4572	NC_020833	GCT	2	6	279719	279724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	472332777
4573	NC_020833	CACT	2	8	279743	279750	25 %	25 %	0 %	50 %	472332777
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4579	NC_020833	GGCTT	2	10	280277	280286	0 %	40 %	40 %	20 %	472332778
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4593	NC_020833	T	7	7	280941	280947	0 %	100 %	0 %	0 %	472332779
4594	NC_020833	TATG	2	8	280969	280976	25 %	50 %	25 %	0 %	472332779
4595	NC_020833	CT	3	6	280978	280983	0 %	50 %	0 %	50 %	472332779
4596	NC_020833	A	7	7	281061	281067	100 %	0 %	0 %	0 %	472332779
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4604	NC_020833	A	6	6	281739	281744	100 %	0 %	0 %	0 %	472332780
4605	NC_020833	GT	3	6	281749	281754	0 %	50 %	50 %	0 %	472332780
4606	NC_020833	ACCG	2	8	281784	281791	25 %	0 %	25 %	50 %	472332780
4607	NC_020833	CAA	2	6	281825	281830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332780
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4609	NC_020833	GCCC	2	8	281963	281970	0 %	0 %	25 %	75 %	472332781
4610	NC_020833	AAC	2	6	282065	282070	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	472332781
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4612	NC_020833	GTT	2	6	282151	282156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	472332781
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4615	NC_020833	TGA	2	6	282432	282437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332781
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4619	NC_020833	TGG	2	6	282563	282568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	472332781
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4621	NC_020833	TTA	2	6	282680	282685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	472332781
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4994	NC_020833	A	6	6	311339	311344	100 %	0 %	0 %	0 %	472332811
4995	NC_020833	GGC	2	6	311408	311413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	472332811
4996	NC_020833	ACC	2	6	311416	311421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	472332811
4997	NC_020833	ATG	2	6	311499	311504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332811
4998	NC_020833	TAA	3	9	311528	311536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	472332811
4999	NC_020833	ATG	2	6	311546	311551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	472332811
5000	NC_020833	TA	3	6	311571	311576	50 %	50 %	0 %	0 %	472332811

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